Fue un arquitecto renacentista español. Especializado en urbanismo e ingeniería militar e hidráulica. Se le conoció en Florencia y Roma como
Giovanni Batista de Alfonsis. Se convirtió en el brazo derecho de
Miguel Ángel. Es posible que Juan Bautista de Toledo haya trabajado con su pseudónimo mencionado como asistente de
Antonio de Sangallo el joven, en la Fortaleza de Basso de Florencia. Asimismo en la Basílica de San Pedro de Roma.
Fue convocado por el virrey
Pedro Álvarez de Toledo y Zúñiga, teniendo que viajar a Nápoles para laborar de arquitecto de
Carlos V. Se le reconoce su mérito de haber diseñado, restaurado y urbanizado
lastrada di Toledo,
la iglesia de San Giacomo degli Spagnuoli; además
los bastiones del Castel Nuovo;
el palacio del Posillipo, entre otras obras.
También se le llamó de parte de
Felipe II a Madrid (1559), para trabajar como arquitecto real, con un buen sueldo (220 ducados), para que se encargase de las obras reales. Entre ellas el
Monasterio de El Escorial, que fue diseñada como ciudad real, palaciega y monacal. Además participó en otras obras como el
Palacio Real de Aranjuez, San Jerónimo el real, Casa de Campo, Alcázar de Toledo, etc.Juan Bautista le proporcionó al rey la “traza universal”, que eran los planos oficiales del Monasterio. Colocándose la primera piedra de aquella edificación. Además él mismo escribió un epígrafe en que explicaba su autoría en la obra.
Falleció en 1567, sin haber visto culminada su obra. Sin embargo, finalizó La Granjilla de La Fresneda, el Patio de los Evangelistas, así como los claustros menores del Monasterio, entre otras obras. Tuvo como ayudante a
Juan de Herrera y luego a
Juan Gómez de Mora.
En la Granjilla de La Fresneda participaron también otros arquitectos como
Gaspar de Vega y
Juan de Herrera. Asimismo los holandeses
Petre Janson y
Spond, quienes fueron de gran ayuda. Por su parte,
Marcos de Cardona se encargó del diseño de los jardines. Sin embargo, se dice que tras la muerte de Juan Bautista, probablemente fue
Juanelo Turriano (ingeniero hidráulico de Felipe II), quien habría culminado los acueductos y los estanques de La Granjilla.
Además se encargó del
Jardín del Rey del Palacio Real de Aranjuez (a mediados del siglo XVI). Fue un jardín adosado ubicado al sur del palacio, diseñado según el paradigma renacentista italiano, que era secreto y exclusivo. No obstante, fue planificado durante el reinado de
Felipe II por el mismísimo Juan Bautista de Toledo, el cual sería edificado desde 1577.
Falleció el 10 de mayo de 1567 en Madrid. Sus restos descansan en la
Iglesia de la Santa Cruz, en el Convento de Santo Tomás de los Padres Dominicos.