Alexander Emmanuel Rodolphe Agassiz, fue un ingeniero de minas, oceanógrafo y zoólogo marino estadounidense de origen suizo, nacido el 17 diciembre 1835 en Neuchâtel, Suiza. Sus padre, Louis Agassiz y su madrastra Elizabeth Cabot Agassiz, emigraron a los Estados Unidos en 1849, por lo que Alexander finalizó en ese país los estudios secundarios y allí también inició la universidad.
Se graduó de la Universidad de Harvard en 1855, y a continuación estudió ingeniería y química, obteniendo la licenciatura en Ciencias en la escuela científica Lawrence de la misma institución, en el año 1857. Dos años más tarde, en 1859, se convirtió en asistente en la United States Coast Survey.
A partir de entonces se especializó en ictiología marina, pero dedicó también mucho tiempo a la investigación, supervisión y explotación de minas. EJ Hulbert, un amigo del cuñado de Agassiz, Quincy Adams Shaw, había descubierto un rico filón de cobre conocido como conglomerado Calumet en la Península Keweenaw del Lago Superior en Michigan. Él los convenció, junto con un grupo de amigos, para que compraran una participación de control en las minas, que más tarde llegaron a ser conocidas como la Calumet y Hecla Mining Company con sede en Calumet, Michigan.
Agassiz fue elegido miembro de la Academia Americana de las Artes y las Ciencias en 1862. Hasta el verano de 1866, trabajó como asistente en el Museo de Historia Natural que su padre fundó en Harvard. Ese verano, hizo un viaje para ver las minas por sí mismo y convirtiéndose después en tesorero de la empresa.
Durante el invierno de 1866 y principios de 1867, las operaciones mineras comenzaron a fallar debido a la dificultad de extraer el cobre del conglomerado. Hulbert había vendido sus intereses en las minas para dedicarse a otros emprendimientos. Pero Agassiz se negó a perder su fe en este negocio, y regresó a ellas en marzo 1867 junto a su esposa y su hijo pequeño.
En ese momento, Calumet era un asentamiento remoto, prácticamente inaccesibles durante el invierno y muy lejos de la civilización, incluso durante el verano. Con suministros insuficientes en las minas, Agassiz luchó por mantener el orden, mientras que de vuelta en Boston, Shaw tenía que cargar con la deuda y el colapso de sus intereses. Shaw obtuvo ayuda financiera de John Simpkins, el agente de venta de la empresa, para continuar con las operaciones.
Agassiz siguió viviendo en Calumet, haciendo un progreso gradual en la estabilización de las operaciones mineras, de manera tal que pudo dejarlas bajo el control de un director general y regresar a Boston en 1868, antes de que el invierno cerrara la navegación.
Las minas siguieron prosperando y en mayo de 1871, varias minas se consolidaron para formar la Compañía de Calumet y Hecla Mining con Shaw como su primer presidente. En agosto de 1871, Shaw se retiró de la junta directiva y Agassiz se convirtió en presidente, cargo que ocupó hasta su muerte.
Agassiz fue un factor importante en el éxito continuo de la mina y las visitaba dos veces al año. Entre sus innovaciones, se cuenta la instalación de un motor gigante, conocido como el Superior, que fue capaz de levantar 24 toneladas de roca a una profundidad de 1.200 metros (4.000 pies). También construyó un ferrocarril y propició el dragado de un canal de aguas navegables. Sin embargo, después de un tiempo, dado que las minas no requerían su atención a tiempo completo durante todo el año, regresó a sus intereses en la historia natural de la Universidad de Harvard.
De la fortuna ganada con el cobre, Agassiz donó unos 500.000 dólares a la Universidad de Harvard para el museo de zoología comparada y otros fines.
En 1875 investigó el Lago Titicaca, en Perú, examinó las minas de cobre de Perú y Chile, y reunió una colección de antigüedades peruanas para el Museo de Zoología Comparada, de la que fue curador entre 1874 y 1885. Asistió a Charles Wyville Thomson en el examen y clasificación de las colecciones de la Expedición Challenger de 1872, y escribió los informes de la Review of the Echini (2 vols., 1872-1874).
Entre 1877 y 1880 participó en las tres expediciones de dragado del vapor Blake, y presentó un informe completo de ellas en dos volúmenes (1888).
En 1896 Agassiz visitó Fiji y Queensland e inspeccionó la Gran Barrera de Coral, publicando un documento sobre el tema en 1898.
Otros escritos de Agassiz sobre zoología marina, están contenidos en los boletines y memorias del Museo de Zoología Comparada; pero también publicó en 1865, con su madrastra, Elizabeth Cary Agassiz, "Seaside Studies in Natural History", una obra precisa y estimulante y, en 1871 "Animales Marinos de la Bahía de Massachusetts".
Agassiz fue presidente de la Academia Nacional de Ciencias, que desde 1913 otorga la Medalla Alexander Agassiz en su memoria.
Murió en 1910 a bordo del RMS Adriático, rumbo a Nueva York desde Southampton.